本发明公开了一种白肉灵芝Z160097的特征性核苷酸序列及其特异引物、试剂盒和鉴别方法。本发明针对不同的白肉灵芝菌株进行ISSR分子标记的扩增，最终找到野生白肉灵芝Z160097的特异条带，并进行克隆测序，再设计特异引物，从而找到野生白肉灵芝Z160097专有的特征性核苷酸序列，建立野生白肉灵芝Z160097的快速准确鉴定方法。野生白肉灵芝Z160097是分布范围极小的新物种，其的快速准确鉴定将为其产业化开发和产权保护奠定基础。