本发明提供一种多维指标综合评分方法及应用，方法包括输入样本数据集合，提取多维指标并使其全部转为正向指标，得出多维样本矢量集；计算所述多维样本矢量集的均值矢量和协方差矩阵；计算所述协方差矩阵的特征值和特征矢量，由大到小取若干个或全部特征矢量作为列矢量构成特征矢量矩阵；所述特征矢量矩阵的每个值均取绝对值作为权重矩阵；根据所述多维样本矢量和所述权重矩阵，计算出多列综合得分后从中选取第一列综合得分或根据相应的主成分方差贡献率加权得出最终综合得分进行评估。本发明提供的方法使得综合评价函数在原始指标的各个分量上都是单增函数，极大改善了综合评分对数据的评估准确度，更好的反映了数据的特性。