本发明公开了一种自愈合型水泥基渗透结晶防水涂料及其制备方法，由以下质量百分比的原料制备而成：硅酸盐水泥35％～55％，石英砂30％～45％，快凝快硬水泥5％～8％，石墨烯改性钢渣微粉4％～8％，碳酸钙1％～2％，元明粉1％～1.5％，核心母料1％～2％，所述核心母料为膨润土、柠檬酸和异丁基三乙氧基硅烷的混合物，所述膨润土、柠檬酸和异丁基三乙氧基硅烷的质量比为100:(30～40):(5～10)；增稠剂1％～2％，上述原料总含量为100％。该水泥基渗透结晶防水涂料自愈合性能好，价格低，且提高了强度和抗开裂性能。