本发明公开了一株耐盐碱阴沟肠杆菌及其活菌制剂生产方法与应用。本发明自盐碱地辣椒根际土壤分离到一株耐盐碱阴沟肠杆菌(Enterobacter cloacae)ZTS‑10，该菌株在中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心(CGMCC)的保藏编号为CGMCC No.20181，保藏日期为2020年7月3日。该菌株耐盐碱能力较强，在盐碱土壤中定植率高，具有产IAA、解磷、解钾能力，能促进辣椒生长，且对辣椒疫病病原菌具有较强的拮抗作用，可用于生产微生物肥料，特别是盐碱地辣椒专用微生物肥料，可减少辣椒疫病发生，提高产量和质量。