本发明提供一种基于SWMM模型的排水深隧系统运行管理评价方法，包括：构建SWMM模型模拟排水深隧系统运行状态，获取排水深隧系统模拟运行数据；根据排水深隧系统的实时在线监测系统获得排水深隧系统实际运行数据；制定排水深隧系统运行管理评价指标S，包括两个准则层指标，及其下划分的方案层指标，设定各准则层指标权重系数及方案层指标权重系数；根据实际运行数据对比根据SWMM模型获得的模拟运行数据分别获得各方案层指标评分值，从而获得排水深隧系统运行管理评价指标S。本发明通过该排水深隧系统运行管理评价方法，基于排水深隧运行的主要指标，考核运营状况，以便后期工作的调整及优化。