一种快速高效的水中有机物自动化分类解析设备及其应用。所述设备包括外壳(1)，所述外壳(1)内部设置有第一多通道选择控制阀(5)、检测器(28)、并联的本底通道和极性分类通道，所述本底通道的一端与所述第一多通道选择控制阀(5)连接，所述本底通道的另一端与所述检测器(28)连接，所述极性分类通道的一端与所述第一多通道选择控制阀(5)连接，所述极性分类通道的另一端与所述检测器(28)连接，所述极性分类通道设置为对待测样品中的目标物质进行截留，并且所述第一多通道选择控制阀(5)设置为与待测样品的输入管道连接。本申请的设备能够快速、高效地分析水中溶解性有机物的组成及含量。