本发明涉及一种微交联阳离子型聚丙烯酰胺絮凝剂及其制备方法与应用。本发明中的微交联阳离子型聚丙烯酰胺絮凝剂，是由丙烯酰胺、甲基丙烯酰氧乙基二甲基苄基氯化铵为主要共聚单体，乙烯基烷氧基硅烷为共聚交联单体，采用反相乳液自由基聚合方法制备得到。其中，乙烯基烷氧基硅烷作为共聚交联单体，在反相乳液聚合反应过程中可使聚合物分子链产生微交联，促进采油污水中化学驱油剂、原油、悬浮物及无机盐等的絮凝与沉降；采用反相乳液自由基聚合的方法，控制聚合反应条件及交联单体添加量，实现了聚合物分子量的提高而不影响其水溶性，使聚合物的吸附、架桥、电中和和疏水缔合作用更强，对含油污水的絮凝分离效果更好。