本发明提供一种复杂地质条件下深基坑支护锚杆施工方法，包括钻孔→锚杆杆体的制作→注浆三步骤。针对涌水量大，注浆困难的问题，在钻孔完成后，灌注水泥浆，待水泥浆自孔口返出后，采用安装止浆塞及锚杆端头封堵器将钻孔孔口和钻杆端部进行密封。针对淤泥层、砂层松散，钻进过程中极易塌孔的问题，借鉴泥浆护壁成孔技术，采用边钻孔边注浆的方法，在钻孔过程中即采用水泥浆代替水进行循环，最大限度的提高塌孔严重区域的水泥浆灌注量。针对钻头优化的问题：由原本设计的十字交叉箭形硬质合金钻头，创新改进成带U型口的一字型硬质合金钻头，增大了注浆口面积，排除了小孔口挤土效应，解决了在超厚淤泥区自进式中空锚杆注浆通道易被堵孔的难题。