本发明公开了高比例水电系统调速器控制模式在线切换方法及系统，本发明用于获取系统当前运行方式，当前时间之后的一段时间内的负荷预测水平、开机计划和外送安排，调速器多控制模式及相应参数；并根据系统当前运行方式以及当前时间之后的一段时间内的负荷预测水平、开机计划和外送安排确定当前时间之后的一段时间内的恶劣运行方式；依次计算调速器配置不同控制模式参数后在恶劣运行方式中各故障下最低的超低频振荡阻尼；用于根据计算模块计算得到的阻尼，判断选择哪个控制模式，并将结果进行输出以进行变速器控制模式的切换。本发明提升了系统的调频能力。