本发明公开一种高精度光纤干涉仪的光纤相位补偿器，采用等长光纤替代法，即令输入端或输出端光纤干涉仪的测量臂中非公共光纤段长度与盲区光纤长度一致，从而等效测量盲区光纤的相位漂移，实现了业务光信号在光纤链路传输的相位漂移检测误差最小化，从而获得更高的相位补偿精度。实验表明，在等长替代光纤长度误差为1cm时，该段等长替代光纤造成的长期(24h)系统相位漂移检测误差小于10fs，短时间(1s)的系统相位漂移检测误差可以忽略不计。