本发明提供了一种穿过高压层和玄武岩垮塌层的井身结构及其构建方法，该构建方法包括：步骤S10，下入第一开次套管串，固井；步骤S20，下入第二开次套管串，固井；步骤S30，第三开次井段钻至高压层上部，下入第三开次套管串，固井；步骤S40，第四开次井段钻穿高压层，且钻进至玄武岩垮塌层上部，下入第四开次套管串，固井；步骤S50，第五开次井段钻穿玄武岩垮塌层，且钻至油气目的层上部，下入第五开次套管串，固井；步骤S60，第六开次井段钻进至油气目的层，下入第六开次尾管串，固井。通过本发明，缓解了在具有高压层和玄武岩垮塌层的地质条件下钻井时，容易出现溢流、井漏、井壁坍塌、卡钻等事故与复杂的技术问题。