本发明提供一种基于医疗大数据的用药预测方法及系统，方法包括：基于训练好的二分类模型，预测出药品用完且未进行新一次买药的目标用户，所述二分类模型是根据历史用户买药数据进行训练得到，并实现购买时间未到导出时间的数据与购买时间超过数据导出时间的数据的分类筛选；关联所述目标用户和药品数据，将关联结果推送给所述目标用户。本发明实施例提供的一种基于医疗大数据的用药预测方法及系统，通过针对性的分析慢病药品购买规律，能更加准确的预测出购买慢病药品的用户下次购买的时间，进而找出已经用完药品但还没有再次购买的人；并且通过模型训练中得出的各特征的占比，可以更准确的计算出最有可能再次回药店购买的用户。