本发明公开一种高硼硅玻璃工业熔窑烟气除尘系统及除尘工艺，其中，所述高硼硅玻璃工业熔窑烟气除尘系统包括降温塔，与所述高硼硅玻璃工业熔窑的进口烟道相连通；冷却装置，设于所述降温塔上，用于将进入所述降温塔的烟气降温至第一预设温度；脱硼脱酸塔，与所述降温塔相连通；中和剂喷射装置，与所述脱硼脱酸塔相连通，用于向输入至所述脱硼脱酸塔的烟气喷射中和剂；布袋除尘器，与所述脱硼脱酸塔相连通，用于对自所述脱硼脱酸塔输出的烟气进行除尘；以及脱硝单元，与所述脱硼脱酸塔相连通，用于对自所述布袋除尘器输出的烟气进行脱硝。本发明能够实现烟气的脱硼脱酸操作，烟气进一步进入脱硝单元时，减少对设备的腐蚀，延长设备使用寿命。