本发明涉及工控信息安全领域，公开了一种实时检测日志序列异常的方法和系统，其包括日志采集，通过主动采集和被动采集的方式获取日志；日志解析，通过drain算法对采集的日志进行解析；并对解析后的匹配正确的日志事件分入相应的日志组；日志异常检测，通过N-gram模型和LSTM模型对解析后的日志实时的进行日志异常检测；基于Drain日志解析算法可实时对工业系统日志流进行自动化解析成工控系统运行状态和各关键节点重要事件的日志事件序列；通过N-gram模型、LSTM模型对解析的日志事件序列进行异常检测，实现对工业控制系统异常进行告警。将工控日志流进行实时自动化解析和系统异常发现告警，使得工控系统故障和攻击能够及时发现。