本发明公开了一种服务器异常溯源方法、系统及存储介质，服务器异常溯源系统包括：服务器信息分析引擎：采集服务器信息，并对采集的服务器信息进行解析以及范式化处理，得到服务器数据；网络流异常分析引擎：采集服务器涉及的网络镜像流量，对采集的镜像流量进行处理并得到异常告警日志，并得到异常告警日志索引；关联分析引擎：对所述服务器数据进行去冗余处理，得到去冗余后的服务器数据索引，将异常告警日志索引和服务器数据索引进行关联分析，确定发生异常的服务器。提高了服务器异常定位能力，并不依赖于服务器自身的网络拓扑结构，自主实现对服务器异常定位溯源能力。