本发明公开了基于多时间尺度的台区电能表误差在线检测方法和系统，涉及电能计量设备检测技术领域，解决了拆回检定导致的换表停电损失与优质供电服务影响的问题。本发明包括数据周期性采集、数据有效性判断与数据的线损计算、构建误差模型、导出计算结果等步骤，对待核查台区的台区总表、台区下所有分表的用电信息数据进行周期性采集，对周期性采集到的数据进行有效性判断，如不合格执行补采操作，数据的有效性合格构建线损模型进行线损计算；本发明基于台区总电量等于各分表电能量及线损之和的能量守恒模型，通过构建不同尺度的采样周期，实现线损的有效估计，提升台区下各分表误差计算的准确性。