一种跨区域电能智慧分配的电网管理方法及系统，具体为：控制子系统接收电源子系统、负荷子系统上报的特性信息,根据特性信息把电源子系统分为新能源电源子系统及传统能源电源子系统，并按照新能源电源子系统的供电时段信息，把新能源电源子系统、负荷子系统分组，属于同一组的成员，其供电或者用电时段一致；控制子系统依次对每一组成员内的电源子系统及负荷子系统按照规则一完成服务关系映射得到映射关系NewMapRelation，对无法完成服务关系映射的负荷子系统按照规则二对负荷子系统进行配对处理得到配对信息MapPairInf；控制子系统按照规则三完成传统电源子系统与MapPairInf成员间服务关系映射得到映射关系TraditionMapRelation；控制子系统配置联络线选通子系统按照NewMapRelation、TraditionMapRelation的映射关系进行工作。