本发明提供了一种基于沉积结构剖面的野外地层测量方法及系统，该方法包括：根据目标地层野外估测的单层厚度信息，建立目标地层中各单层的沉积结构格架；识别目标地层中各单层沉积界面，并用相应的曲线和符号标示出来；识别各单层沉积变化并用渐变曲线、层理构造和岩性符号表示，以确定各单层沉积纵向变化；根据各单层的沉积结构格架、单层沉积界面及单层沉积纵向变化绘制各单层沉积结构素描图；将样品点及其编号投在各单层沉积结构素描图中，得到目标地层的沉积结构剖面素描图；根据各单层沉积结构素描图，绘制目标地层的沉积结构剖面素描图，得到沉积结构剖面图；计算目标地层各单层真实厚度，并对沉积结构剖面图进行校正。