本发明属于微生物次级代谢产物应用技术领域，具体涉及一种灵菌红素在抗马铃薯Y病毒中的新用途。所述灵菌红素在制备防控马铃薯Y病毒药物中的应用。防控马铃薯Y病毒药物为含有灵菌红素的液态或固态制剂。明确了PVY在侵染寄主过程中，通过招募宿主因子Hsp70来促进自身的复制侵染，实现病毒的侵染和传播，Hsp70对植物病毒的侵染复制具有重要作用。基于以上研究结果，进一步明确了灵菌红素处理可显著提升植物寄主的泛素化水平，促进寄主HSP70蛋白发生泛素化，降解或抑制Hsp70蛋白的表达，激活寄主植物天然免疫活性，诱导植物寄主产生系统抗性，实现抗病毒特征。