本发明涉及生物技术和食品加工技术领域，更具体地，涉及一种苹果风味饮料及制作方法。所述方法包括以下步骤：将苹果皮渣置于柠檬酸溶液中浸泡、制备培养基、一阶段黑曲霉发酵、破碎黑曲霉细胞、均质、二阶段益生菌发酵。针对现有技术中苹果皮渣大量的纤维素和果胶等大分子物质，难以利用，若废弃，污染环境，苹果皮渣难以被单一微生物降解的技术问题，本发明提供的一种苹果风味饮料的制作方法，苹果皮渣置于柠檬酸溶液中浸泡能防止褐变，便于生产化周转，黑曲霉和益生菌在不同阶段发酵，二阶段发酵利用一阶段的产物，最终制得的苹果风味饮料，具有益生菌活细胞数高等优点，实现了苹果皮渣的废物利用。