本发明涉及橡胶材料技术领域，具体公开一种低蛋白天然胶乳的制备方法：取浓缩天然胶乳，加入稳定剂和尿素，得预处理的天然胶乳；加入蛋白酶，离心浓缩得低蛋白天然胶乳；补加氨水，同时加入磷脂类物质和脂肪酶进行保存。本发明采用尿素破坏天然胶乳蛋白质的氢键作用，利用蛋白酶对结构松弛的蛋白质进行高效水解，再通过离心浓缩除去天然胶乳中的部分蛋白质，补加适量氨水，同时加入磷脂类物质和脂肪酶，通过氨与脂肪酶共同作用促进磷脂类物质分解形成的长链脂肪酸盐，进一步与氨水反应形成脂肪酸铵，并吸附在橡胶烃粒子表面，加速胶乳粒子保护层水化膜的形成并使其增厚，提高天然胶乳的机械稳定性，实现生产低蛋白天然胶乳的技术目的。