本发明涉及一种医疗器械自动消毒装置；其解决的技术方案包括箱体,箱体底部有三个互不连通的腔体,右侧的腔体底面高于左侧的腔体底面,箱体的左侧设有一个消毒水箱,箱体的右侧设有一个清水箱左右两侧的腔体内各设有一个浮体,箱体设有多组监督可转动的平板,每个平板的上方设与多组间隔排布的消毒水喷头、清水喷头和紫外线灯，箱体的前后内侧壁上各设有一个具有向外弹出趋势的楔形块，每个楔形块的上方设有一个置于对应竖杆正上方的阻尼杆，阻尼杆被压缩时缓慢收缩，阻尼杆不与对应竖杆接触时消毒水喷头打开，左侧竖杆向上移动挤压阻尼杆后消毒水喷头关闭，清水喷头打开，右侧竖杆向上移动至平板趋于水平时，清水喷头关闭紫外线灯管打开。