本发明公开了农作物栽培基质中水肥含量原位检测装置及其检测方法，该农作物栽培基质中水肥含量原位检测装置包括：水肥原位采集器和光谱分析设备，所述水肥原位采集器预埋在栽培基质中用于时刻采集栽培基质内的水肥，获得测定样品，光谱分析设备用于发射特定波长的激光对水肥原位采集器内采集的测定样品进行检测分析测定样品内氮、磷、钾的含量，所述水肥原位采集器与光谱分析设备之间设置有用于连续输送测定样品的连续进样系统，本发明能够对栽培基质中的水肥进行采集，并对采集得到的水肥内的氮、磷、钾等养分的含量进行原位在线分析和检测，能够直观的反映土培基质内各养分的浓度，且检测数据准确，并且整体结构工作稳定，方便使用。