本发明提供变电站智能多路电压核相仪控制方法，包括以下步骤：设定工作模式，计算待核电压回路的过压欠压判别单元定值；通过隔离采样单元对参考基准电压及待核电压进行隔离采样；计算参考基准电压和待核电压的压差，通过压差特征对待核电压回路进行智能故障诊断；通过压差波形显示单元对压差波形显示及相应压差有效值显示。本发明还提供变电站智能多路电压核相仪。本发明提供的变电站智能多路电压核相仪控制方法能对变电站二次三相电压回路同时进行核相，提高核相速度，利用过压判别元件与欠压判别元件进行故障判别；通过隔离采样单元，有效提高检修作业人员现场核相工作的安全性，降低检修人员的劳动强度，节约生产成本，提高企业经济效益。