本发明公开了一种菌剂自动添加河流水质改善系统，包括主架装置、水流穿越装置、涡轮转动装置、菌剂储存装置、菌剂排放装置、排放控制装置、蓄电装置、发电装置、水质监测装置；主架装置包括左右支架、左右底座及其固定装置，水流穿越装置包括水流穿越管道和中心管道，涡轮转动装置叶轮通过轴承连接于中心管道两侧，内置电线分别与蓄电装置、信号接收器相连，菌剂储存装置安装于水流穿越管道内部与流水空隙之间，菌剂排放装置排放管连通于外界，排放控制装置包括信号接收器和自动阀门，蓄电装置通过电线与涡轮装置、排放控制装置、水质监测装置相连。该系统通过水体流速水体净化菌剂精准自动化添加，实现了水体自动监测与定量降污一体化。