本发明涉及一种深水围堰可调底隔舱及其施工方法，其包括：用于固定于围堰的双壁板底隔舱；滑槽，固定于所述双壁板底隔舱的一侧；单壁板底隔舱，组装于所述滑槽，且可沿所述滑槽上下移动，所述单壁板底隔舱与所述双壁板底隔舱并列设置；当所述双壁板底隔舱与所述围堰一同下降至围堰设计底标高后，所述单壁板底隔舱可沿所述滑槽下移至封底底面以下。本发明涉及的一种深水围堰可调底隔舱及其施工方法，可同时满足抵抗土压力和封底底面设于围堰底以下的“锅底状”封底，能够增加封底的厚度。