本发明涉及针对南方根结线虫的杀线虫组合物及其应用。该组合物由噻唑膦和吡虫啉按质量比1:3构成。该组合物用于制备针对南方根结线虫(尤其是番茄南方根结线虫)的杀线虫农药制剂。本发明将噻唑膦与吡虫啉两种有效成分组合，在防治南方根结线虫(尤其是番茄南方根结线虫)方面作用机理不同并且不存在交互抗性，两者组合物具有明显的协同增效作用，并且对靶标害虫的防治效果明显优于噻唑膦与吡虫啉单剂，延缓了南方根结线虫抗药性的产生和发展，降低了农药使用量，从而降低了成本和减少了对环境的污染。