本发明涉及一种基于三维地基模型生成及变量输入的自动化土工目标模型生成系统及土工目标模型生成方法。本发明地土工目标模型生成系统包括：输入模块，其将三维地形形状模型和钻孔柱状信息存储于系统；三维地基模型生成模块，其运用通过所述输入模块输入的所述三维地形形状模型和所述钻孔柱状信息来生成三维地基模型；法面信息生成模块，其利用由所述三维地基模型生成模块生成的所述三维地基模型来生成考虑了各岩质的设计条件的三维法面信息；以及法面条件设定模块，其设定所述设计条件。