本公开涉及图像处理技术领域，具体涉及一种基于深度神经网络可视化的眼底图像生成方法及系统，其中所述方法包括：病理感知网络可视化模型获取眼底图像分类网络模型中各卷积层提取的多个特征图构成第一特征图集合；基于第一预设参数对所述第一特征图集合进行筛选得到第二特征图集合；基于第二预设参数对所述第二特征图集合进行筛选分类得到第三特征图集合；基于所述第三特征图集合中的特征图融合生成所述眼底图像的预设病理区域对应的可视化图。本公开实施方案可以提高生成的眼底图像在病理区域的图像质量，提高辅助诊断的准确性。