本发明公开了一种地下水资源三维可视化动态监测结构模型的构建方法，所述方法具体如下：第一步，获取监测区域地貌特征，第二步，地下水资源承载条件获取，第三步，地下水资源地脉建模，第四步，地下水资源水流监测，第五步，地下水资源存储结构建模，第六步，建立地下水资源水质监测模型，第七步，对上述动态的模型建模数据分别建立可视化预测模型，本发明的地下水资源三维可视化动态监测结构模型的构建方法；能够对地下水监控和保护提供可视化依据，同时能够给开采提供真实的参考数据，大大缩短了开采前的勘探和理论分析工作，同时对开采过程和开采后实时监测，避免错误开采或过渡开采等问题。