本申请涉及用于确定多核苷酸的核苷酸序列的仪器和方法。一种方法，包括使掺入试剂流动通过仪器的试剂管理系统和流动池。流动池具有定位于其中的第一多核苷酸。掺入试剂将第一碱基添加到碱基序列上。碱基序列包括与第一多核苷酸互补的第二多核苷酸。在第一碱基已经被添加到第二多核苷酸上之后，捕获从第一碱基发出的鉴定信号的图像。使裂解试剂流动通过试剂管理系统和流动池以从第一碱基去除第一终止剂，以便使碱基序列中随后的碱基能够被添加至第二多核苷酸。使缓冲试剂以多于一个循环的连续的正向流动方向和反向流动方向流动通过试剂管理系统和流动池。