本发明公开一种用于待测样品间麦角硫因含量高低的高通量检测方法及其应用，属于微生物育种的技术领域。本发明将待测样品调节pH 1.9～2.0，先加入硫氰酸铁溶液于酶标板中，再加入待测样品，吹打混合；使用酶标仪记录吸光度，酶标仪所用波长为450nm～470nm；吸光度越低，麦角硫因含量越高。该方法具有高效、快速，方便，成本低的特点，适用于不需要准确测定每一种样品的麦角硫因含量的研究活动；克服了使用LC‑MS检测方法耗时、成本高的缺陷。