本发明涉及一种强电磁场环境下提高变电站沉降监测精度的方法及系统，该方法包括：对变电站内外的可选探测点位进行编号，并标注各个可选探测点位的平面坐标；测试并记录各个可选探测点位的电磁场强度；根据各个可选探测点位的平面坐标和电磁场强度绘制变电站待监测区域的电磁场强度等值线图或等色图；根据等值线图或等色图，结合探测点位的选择条件，在可选探测点位所在区域中选择电磁场强度弱的点位作为基准站点位或监测站点位；使监测网的布置更为合理，解算后的监测结果更为可靠。