本发明公开了岩原鲤亲子鉴定试剂盒及其微卫星PCR鉴定方法。提取岩原鲤个体样本的基因组DNA；进行PCR扩增：岩原鲤亲子鉴定用引物组中的20对微卫星引物的每对引物的正向引物的5’端标记上荧光物质，利用上述引物组中的各标记荧光引物对获得的DNA基因组进行梯度PCR扩增，扩增产物在测序仪上进行毛细管电泳，读取每个个体的等位基因大小，获取基因分型数据；岩原鲤家系的亲子鉴定分析：基于基因型数据进行亲本和子代数据分析，根据子代基因型和亲本基因型之间的相关性，确定子代与亲本间的亲子关系。本发明方法简单、快捷、高效、经济，可在岩原鲤繁殖群体的家系管理、群体遗传变异研究和增殖放流效果评估提供技术途径。