本发明实施例涉及通信技术领域，公开了一种应用程序的禁用方法、系统、服务器及存储介质。本发明中的应用程序的禁用方法包括：获取各应用程序的特征值，特征值根据应用程序的流量数据中重复出现的内容提取得到；在接收到对目标终端的应用程序禁用请求后，查找到请求禁用的应用程序的特征值，并将查找到的特征值作为目标特征值下发给网关设备，供网关设备根据目标特征值，对待发送给目标终端的流量数据进行过滤，禁止将流量数据中与目标特征值匹配的流量数据发送给目标终端。通过以上技术手段，实现了应用层的流量管理，自动过滤目标应用的流量数据，避免上网用户受到不良信息的负面影响。