本发明公开了一种适于油菜毯状育苗的种子包衣剂及其应用，种子包衣剂按照重量份计，包括以下组分：氰霜唑1‑5份、吡虫啉1‑5份、烯效唑1‑5份、助剂80‑100份和硼0.1‑0.5份；包衣剂适用于油菜机械化育苗和机械化移栽，简单易操作，可以有效针对毯状育苗高温高湿条件下各种病虫害的发生，通过在油菜种子上包衣剂阻止和抑制根肿病病原菌的存活和传播，从根源上有效减少和阻断病虫害的发生，防治效率更高；包衣剂通过抑制根部病害，能够有效提高毯状育苗的根系生长能力，便于毯状成苗及其机械化种植；在防治病害的同时，加入了烯效唑和硼，抑制种苗疯长，充分补充土壤所缺营养和微量元素；可以有效防治毯状育苗阶段的油菜猝倒病、霜霉病、根肿病及蚜虫等常见病虫害。