本发明公开了基于营配一体的台区故障定位方法及系统，从线路分支末端注入脉冲信号，接收线路上各故障指示器响应于脉冲信号发送来的感知确认报文及其身份标识；根据报文和身份标识以及分支线路上出口断路器的位置确定网络拓扑结构；根据网络拓扑结构确定出线路上各故障指示器和断路器的网络节点关系以及故障发生时各故障指示器和断路器上送的故障数据对故障进行定位，获得台区故障定位结果。本发明实现了营配信息共享，有效解决低压配电台区故障识别信息不全、难以定位问题，从而实现低压台区故障快速定位，减少故障隐患，提高用户供电可靠性。