一种背靠背混联H桥变流器控制方法及装置，适用于轨道交通同相供电系统，变流器由多个投运模块和备用模块组成，各模块H桥的其中一侧级联成高压输出，另外一侧分别接至牵引匹配变压器的一个低压绕组。正常工作时，由投运模块承担功率传输任务，备用模块的并联侧接触器闭合，并联侧脉冲封锁，级联侧两个桥臂的下管IGBT导通续流、上管IGBT关断，处于低功耗准热备用状态。当投运模块出现故障时，该模块级联侧旁路开关闭合、并联侧接触器断开，模块被快速切除，同时备用模块并联侧和级联侧脉冲解锁，转为运行状态。本发明可以有效降低系统损耗，同时又具备响应时间短的优点，在提高系统可靠性的同时兼顾了系统的效率。