本发明提供一种物资合同资金支付审批管理系统及方法，包括信息审核子系统、审批子系统和支付子系统；所述的信息审核子系统，用于获取用户提交审批信息，并对审批信息进行验证，验证通过时，按支付类型以及支付对象分别汇总为若干付款单发送给用户；接收到用户对付款单进行核对后返回的确认信息后，信息审核子系统将经用户确认后的付款单发送给审批子系统；所述的审批子系统，用于根据接收到的付款单所对应的审批流程，依次进行每个审批环节的审核，最终审核通过后形成支付指令发送到支付子系统；所述的支付子系统，用于接收到支付指令后，创建当前支付指令付款项进行实际支付。