本发明属于工业微生物技术领域，涉及用于强乳化三元复合驱采出水破乳的硝酸盐还原菌的筛选方法。一种用于强乳化三元复合驱采出水破乳的硝酸盐还原菌的筛选方法，包括：(1)对接种物进行富集培养，并对其产物进行分离、纯化；(2)从分离、纯化的培养物中筛选烷烃降解菌；(3)从得到的烷烃降解菌中进一步筛选具有硝酸盐还原特性的烷烃降解菌；(4)利用多元线性回归方程预测步骤(3)筛选出的菌对三元复合驱采出水的破乳效果。本发明提供了具有烷烃降解、硝酸盐还原和生物破乳功能的微生物菌剂的高效筛选方法；该筛选方法可对油田强乳化的三元复合驱采出水的生物处理提供重要的指导作用，有效推动了油田三元复合驱采出水的处理技术的进步。