本发明提供了一种利用新型葡萄糖醛酸酶生物催化制备甘草次酸的方法，步骤为：通过基因工程手段筛选表达新型重组葡萄糖醛酸酶；以甘草酸为底物进行催化反应，得到纯度较高的甘草次酸；在磷酸盐缓冲溶液环境下，将β‑葡萄糖醛酸酶、Fe3O4@Zr‑2MIm孵育得到固定化酶；用固定化酶和甘草酸进行催化反应，得到甘草次酸。本发明中筛选出的β‑葡萄糖醛酸酶催化活性高，在2h内就能够将甘草酸快速完全的转化，且不会产生中间产物单葡萄糖醛酸甘草次酸，方便得到高纯度的甘草次酸。同时本发明的固定化酶可以回收再利用，降低了生产成本，工艺简单，经济节约，非常适合于大规模工业化生产。本发明的固定化酶对甘草酸的转化率达到95%以上，底物甘草酸基本完全转化成甘草次酸。