本发明属于基因工程领域，具体涉及通过对地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)2709进行遗传改造获得的新型宿主细胞及其改造方法与应用。所述菌株是在地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)2709的基础上，通过敲除eps、pgs、sigF、chiAB、pulA、amyA、lchAC、upp基因，并删除9个基因组岛以实现宿主细胞的基因组精简来构建的。经过基因改造获得的宿主细胞有效改进了发酵生产性能及发酵过程控制。以AprE的生产为例，eps、pgs、sigF、chiAB、pulA、amyA、lchAC基因，和9个基因组岛敲除菌GR15对AprE的发酵液酶活力可高达32494±1013U/mL，高产酶时期长达16h，较对照菌提高了36％。