本发明公开了一种应用于两相分配生物反应器的硅油在线回收工艺，属于生物技术领域本工艺使用的装置包括：反应器本体，吸收容器，吸收容器设于反应器本体一侧，吸收容器通过连通管体与反应器本体连通；反应器本体底部分别设有气相入口和液相进出口，液相进出口和连通管体连通，连通管体上还设有泵体和流量控制器；吸收容器底部设有磁场产生装置。本发明所提供的回收工艺对反应器内菌体生长无影响，实现了实现反应器内磁性硅油的较高次数的回收和添加，并且减少了磁性硅油的损耗量，所回收的磁性硅油对DCM有较高的降解效率。