一种电网故障诊断方法和系统，该方法包括以下步骤：S1、实时获取配电网录波器和A/B两套保护中的录波文件；S2、保护动作发生时，确认录波器中是否获得存有录波文件；S3、根据步骤S2中的确认结果进行对应的数据分析，从而进行故障诊断，确认是否为装置异常或者确实发生故障及得出故障原因。该系统包括：数据采集模块、判断模块和数据分析模块；数据采集模块用于实时采集配电网录波器和2套保护中的录波文件；判断模块，接收数据采集模块传输的信息，并判断录波器中是否有录波文件。本发明通过对二次设备数据的分析处理及时进行故障诊断，提高二次设备数据的利用率，从而很好的保证配电网的安全稳定运行。