本发明公开了一种基于复式洪水过程校正流域不透水率的方法，包括收集目标研究流域的一场复式洪水过程的径流资料和降雨数据，结合目标研究流域的土地利用类型数据，计算获取目标研究流域的初始不透水率；在目标研究流域面文件中添加水文单元，生成目标研究流域的流域模型，为各水文单元选择相应的计算方法；固定流域模型的初始条件和边界条件，初步估算各水文单元计算方法的参数初值，将峰值误差百分比函数作为目标函数，使用优化算法推求目标函数的最小值，确定参数的最优值；检验模拟洪峰与实测洪峰的关系；根据检验结果，校正目标研究流域的不透水率。优点是：在掌握资料较少的情况下通过较简单的操作，仍旧可以得到较高精度的不透水率。