本发明涉及一种燃料电池系统的自加湿阳极燃料循环系统及方法，包括分流器、燃烧器、燃气换热器、混合器、预重整器和空气换热器；从燃料电池阳极和阴极各分出一股物流，阳极分出的进入分流器，阴极分出的进入燃烧器；物流进入分流器后分成两股物流，分别进入燃烧器和燃气换热器，从燃烧器流出的物流经过空气换热器排出到大气中，从分流器分出的另一股物流经过燃气换热器进入到混合器，天然气从外界通入到混合器，经混合器混合后进入到预重整器，从预重整器流出的物流，经燃气换热器进入到燃料电池阳极，从外界经过空气换热器，流入到燃料电池阴极。本发明提高了系统直流电效率和系统燃料利用率，且使用换热设备少，节省系统成本。