本发明涉及石油开采领域，公开了一种可生物降解微乳液清洗剂及其制备方法与应用。该清洗剂为中相微乳液，基于所述清洗剂的总重，包括：油相5‑10wt％、表面活性剂0.5‑5wt％、助表面活性剂5‑15wt％、无机盐1‑6.5wt％和水63.5‑89.5wt％；其中，所述表面活性剂为α‑磺基脂肪酸甲酯盐和/或醇醚磺基琥珀酸单酯盐；所述清洗剂的粒径分布范围为15‑40nm。该清洗剂可实现常温下对采出液沉积物中原油的高效清洗，同时自降解性能良好，适应性强，便于现场应用。该清洗剂在常温下的除油率达到93％以上，7天的自降解率达到95％以上。