一种基于成因及形态分析的湖底扇含砂率预测方法，包括：选取建模对象：选取钻遇湖底扇主体、能够真实反映湖底扇含砂率的探井作为样本，统计探井钻遇的湖底扇含砂率；选择综合评价指数中的评价指标：选择对探井钻遇的湖底扇含砂率有影响的指标；对综合评价指数中评价指标进行标准化：对选择出的各个评价指标进行自身评分；确定综合评价指数中评价指标权重；计算综合评价指数，是通过各个指标单项得分累积得到；以综合评价指数为横坐标、湖底扇含砂率为纵坐标，建立综合评价指数与湖底扇含砂率的定量关系图；根据综合评价指数与湖底扇含砂率的定量关系图，对目标湖底扇含砂率进行定量预测。本发明能够定量预测未钻目标湖底扇的含砂率，准确率较高。