本发明公开了一种适用于大型输气管道枢纽站的设计方法，包括：通过大型输气管道枢纽站中不同管线站场间的跨接联络管线的水力模型，确定各条跨接联络管线的设计参数；通过负荷分配控制系统对所述枢纽站中不同管线站场间的各个压缩机组进行负荷分配控制，根据枢纽站的运行方式，确定采用单条管线站场压缩机组负荷分配控制器或枢纽站多条管线站场的压缩机组负荷分配控制器；对枢纽站的ESD系统整合进行分级设计，确定枢纽站中各级ESD系统的设计参数以及各级ESD系统对应的触发条件和触发动作；根据枢纽站的定量风险分析数据对枢纽站进行定量风险评价，并确定对应的风险降低方法。