本发明公开了一种适应于港口智慧能源站的模块化电源灵活组网方法，计算满足港口充电负荷功率需求的变流器并联数量γnum；判断γnum的区间，若n≤γnum＜n+1时，则判定变流器多机并联系统为状态n，启动n台变流器多机并联；若运行状态为状态n且已启动的变流器未发生故障，则返回步骤1继续执行；若运行状态为状态n且已启动的变流器发生故障数为1，则切除故障变流器，发送信号启动备用变流器，然后返回步骤1继续执行；若运行状态为状态n且已启动的变流器发生故障数为大于1，则减负荷运行或系统停止运行。本发明提高港口智慧能源站模块化电源的兼容性和可扩展性，能快速切除故障模块并投入备用模块，保证系统可靠运行。